Вдоль водохранилища идет знаменитый Памирский тракт - одна из самых высокогорных автомобильных дорог мира. Прокладывать тракт начали русские военные инженеры в конце XIX века. В 1930-1940-ые годы тракт был продлен во внутренние районы Горно-Бадахшанской области.
В 1980-ые годы советская власть начала использовать рекреационный потенциал водохранилища и возвела несколько пансионатов. Сегодня Токтогул популярен у любителей семейного отдыха, фанатов рыбалки и даже дайверов, облюбовавших узкую восточную часть водохранилища, где вода отличается особой чистотой.
Токтогул в теплое время года также любят посещать фотографы.
Среди обитателей озера - сазаны, толстолобики и карпы, форель.
